htseq生物信息-生物信息是啥
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链特异性建库测序原理
1、nexteraxt建库原理包括DNA片段修复、PCR扩增、PCR产物纯化、电泳检测等。DNA片段修复：首先***用TTATP酶和天然硫代硫酸盐等试剂对DNA样品进行修复处理。PCR扩增：将链接DNA片段通过PCR扩增进行文库扩增。
2、两条链基因重排后可形成千万种不同特异性的TCR分子，可识别环境中多种多样的抗原。正是这种随机重排导致的TCR多样化使免疫系统在识别和杀伤特异外源性抗原时更为快速、准确和有效。过于多样化也是目前免疫组学测序最大的问题。
3、在测序的时候加进去的主要是两个东西，一是带荧光标记的dNTP（3‘末端是被一个叠氮基堵住的），二是聚合酶。聚合酶就会选择哪个dNTP是和原来位置上的那个碱基是互补的，根据互补性原理，把这个dNTP合成到新的链上去。
转录组定量工具-featureCounts安装及使用
1、根据第1列是Geneid，第7，8列是counts数，用awk提取出geneID和counts。
2、RPKM/FPKM适用于基因长度波动较大的测序方法，如lncRNA-seq测序，lncRNA的长度在200-100000碱基不等。TPM的计算方法也同RPKM/FPKM类似，首先使用式2计算每个基因的表达值，去除基因长度的影响。
3、使用RNACocktail你可以组合不同的分析工具，从而一步完成流程分析。
4、我并不盲从，此前一直使用FPKM，Nature、Science和Cell文章都能看到FPKM的身影。不过我最近对转录组定量归一化方法有了新的认识，借此机会同大家分享几种归一化方法的异同和分析工具。
5、BayesSpace是一种完全贝叶斯统计方法，它使用来自空间邻域的信息来增强空间转录组数据的分辨率并进行聚类分析。
生物信息学一些基本的常用软件有哪些
1、AUGUSTUS ：是真核基因组结构从头预测软件，主要运用广义隐马尔可夫的概率模型（GHMM）进行基因结构的预测。通过分析DNA序列在概率模型中最有可能的基因结构，从而发现目标DNA序列中的基因。
2、建立基础知识：先学习生物学、计算机科学和统计学的基础知识，掌握常用的生物学术语和基本的编程概念。可以参考一些经典教材如《生物信息学导论》、《R语言实战》等。
3、最常用的东西：1，你需要会用 Linux，会使用 bash 2，高于入门级的统计学知识，以及一门统计语言，比如 R 3，至少一门编程语言，一般来讲 C++， Perl， Python， Java 这几种中的一种。
4、生物信息学是一个跨学科的领域，目的是开发理解生物数据的方法和软件工具。生物信息学作为一个跨学科的科学领域，结合了生物学、计算机科学、信息工程、数学和统计学的相关知识用于分析和解释生物数据。
如何自学生物信息学
1、参加培训课程：有许多机构和大学提供生物信息学相关的培训课程。你可以选择参加这些课程，以便系统地学习生物信息学的知识和技能。自学：除了参加培训课程外，你还可以通过自学来掌握生物信息学的知识。
2、从现有的生物信息学工具开始，要熟悉如何利用先用的软件、网络服务器、数据库等等，为生物研究服务，不要做重复工作，能用现成的就不自己开发。
3、一门脚本语言，个人推荐Python（Perl也可以，各有利弊，Python更新兴一些）。Linux系统。这个也不是百分百要求，但是专业的生信人，都是用Linux的，而且很多软件都是不支持Windows的。
关于htseq生物信息，以及生物信息是啥的相关信息分享结束，感谢你的耐心阅读，希望对你有所帮助。
