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蛋白质组学tmt-蛋白质组学名词解释

蛋白质工程 3周前 (04-29) 9

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利用软电离技术（ESI或MALDI）对肽段进行离子化，雾化的多肽可以通过离子迁移率进一步分离，从而降低一级质谱（MS1）的复杂性和二级质谱（MS2）的污染，并最终实现更大的蛋白质组覆盖率。

对分离的蛋白质进行鉴定是蛋白质组研究的重要内容，蛋白质微量测序、氨基酸组成分析等传统的蛋白质鉴定技术不能满足高通量和高效率的要求，生物质谱技术是蛋白质组学（Proteomics）的另一支撑技术。

（图片来源网络，侵删）

质谱分析技术在蛋白质组学研究领域和生物大分子研究领域中，是相当重要的分析技术。

它通过测定蛋白质的质量来判别蛋白质的种类。当前蛋白质组研究的核心技术就是双向凝胶电泳－质谱技术，即通过双向凝胶电泳将蛋白质分离，然后利用质谱对蛋白质逐一进行鉴定。

1、生物质谱技术是蛋白质组学研究中最重要的鉴定技术，其基本原理是样品分子离子化后，根据不同离子之间的荷质比（M/E）的差异来分离并确定分子量。

（图片来源网络，侵删）

2、质谱技术MS：是目前分析蛋白质的主要手段之一。质谱技术可以检测蛋白质的质量、序列、修饰和定量等信息，包括基于母离子扫描MS和tandem MS（MS/MS）等多种方法。

3、蛋白质组学的研究策略主要包括如下：质谱法：通过测量蛋白质的质量来研究其特性，包括串联质谱技术（MS/MS）用于确定蛋白质的氨基酸序列和翻译后修饰等信息。

4、一双向电泳。双向电泳（two-dimensional electrophoresis， 2-DE）与质谱（mass spectrum， MS）的结合是最常见的蛋白质组学的研究手段。

5、质谱技术，如ESI-MS/MS和MALDI-TOF-MS，发展迅猛，它们不仅具有高灵敏度，还具备快速多用途的特点。定量蛋白质组学方法如SILAC、ICAT和iTRAQ各有所长，其中iTRAQ凭借其广泛的应用，但其可重现性和动态范围仍有提升空间。

6、最后这些蛋白质就可以在质谱系统中进行分析，从而得到蛋白质的定性数据；这些数据可以用于构建数据库或和已有的数据库进行比较分析。

【答案】：蛋白质组学（Proteomics）：指在大规模水平上研究蛋白质的特征，包括蛋白质表达水平，翻译后修饰，蛋白与蛋白相互作用等，由此获得蛋白质水平上的关于疾病发生，细胞代谢等过程的整体而全面的认识。

应用蛋白质鉴定：可以利用一维电泳和二维电泳并结合Western等技术，利用蛋白质芯片和抗体芯片及免疫共沉淀等技术对蛋白质进行鉴定研究。

蛋白质组学研究的基本技术对于蛋白质组学的研究来说，它的最基本的实验手段就是利用双向凝胶电泳（two-dimensional protein electrophoresis， 2DE），在整个基因组水平上检测蛋白质表达的情况。

蛋白质组学的重要性在于它能解答关于疾病的关键问题，如蛋白质表达的差异、定量分析、定位研究以及翻译后修饰和相互作用（蛋白质组学解锁健康与疾病的密码）。

说到靶向蛋白质组学，咱们都知道，一直以来蛋白质组学的应用领域主要是针对基础生物学，比如研究通路、蛋白复合物、互作网络，表征细胞和组织的类型，观察细胞周期内蛋白质的表达等。

1、蛋白质组学的研究内容包括：蛋白质鉴定：可以利用一维电泳和二维电泳并结合Westemn等技术，利用蛋白质芯片和抗体芯片及免疫共沉淀等技术对蛋白质进行鉴定研究。

2、主要有两方面，一是结构蛋白质组学，二是功能蛋白质组学。其研究前沿大致分为三个方面：① 针对有关基因组或转录组数据库的生物体或组织细胞，建立其蛋白质组或亚蛋白质组及其蛋白质组连锁群，即组成性蛋白质组学。

3、对人类而言，蛋白质组学的研究最终要服务于人类的健康，主要指促进分子医学的发展。如寻找药物的靶分子。很多药物本身就是蛋白质，而很多药物的靶分子也是蛋白质。药物也可以干预蛋白质-蛋白质相互作用。

蛋白质组（Proteome）一词，源于蛋白质（protein）与基因组（genome）两个词的组合，意指“一种基因组所表达的全套蛋白质”，即包括一种细胞乃至一种生物所表达的全部蛋白质。

蛋白质组（Proteome）的概念最先由Marc Wilkins提出，指由一个基因组（Genome），或一个细胞、组织表达的所有蛋白质（protein）. 蛋白质组的概念与基因组的概念有许多差别，它随着组织、甚至环境状态的不同而改变。

蛋白质分子在偏离其等电点的pH条件下带有电荷，因此可以在电场中移动；当蛋白质迁移至其等电点位置时，其静电荷数为零，在电场中不再移动，据此将蛋白质分离。

此技术也主要用于研究蛋白质之间的相互作用，不仅有高通量及简便的特点，还具有直接得到基因、高选择性的筛选复杂混合物、在筛选过程中通过适当改变条件可以直接评价相互结合的特异性等优点。

① 技术创新性较高：蛋白质组学技术起步相对晚，仍处在技术红利期中 ② 不一样的研究视角：从DNA、mRNA到蛋白质，存在三个层次的调控，即转录水平调控，翻译水平调控，翻译后水平调控。

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