上海蛋白质测序-上海蛋白质测序中心***
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文章信息一览：
蛋白质的N末端测定
1、例如N-端序列影响蛋白质的半衰期，同时关联着蛋白亚细胞器定位等，这些与蛋白的功能和稳定***息相关，对蛋白进行N-端测序分析，有利于帮助分析蛋白质的高级结构，揭示蛋白质的生物学功能。
2、Sanger试剂用于鉴定蛋白质和多肽的N－末端氨基酸残基。Edman降解才是氨基酸序列的测定技术。但是它不能测超过40个残基的序列。所以测大的蛋白质的序列时，需要用化学试剂将蛋白质降解为一些肽段。即需要水解。
3、怎么从进化的角度看待蛋白质结构与功能间的关系？/？2蛋白质一级结构测定的基本策略和步骤？回答第二个问题。一级结构测定，可以从N末端测序，或C末端测序。
ATAC-seq测序原理(染色质可及性)
将ChIP与第二代测序技术相结合的ChIP-Seq技术，能够高效地在全基因组范围内检测与组蛋白、转录因子等互作的DNA区段。
相比chip-chip，chip-seq提供了更高的分辨率，更少的noise以及更大的覆盖度。随着二代测序成本的快速下降，chip-seq将成为研究基因表达调控和表观遗传学必不可少的工具之一。
在这里，我们描述了Cleavage Under Targets and Tagmentation （CUT&Tag），它是一种酶栓系（enzyme-tethering）策略，提供了高效的高分辨率测序文库来分析不同的染色质成分。
严格比较同一单细胞中的基因表达和染色质可及性，可以阐明这些机制的耦合或解耦如何调节fate commitment的逻辑（ 看来这里分析的是单细胞多组学的RNA & ATAC）。
随着测序成本的降低，ChIP- seq已成为研究基因调控和表观遗传机制不可或缺的工具。原理：甲醛处理细胞使目标蛋白与DNA交联，通过超声波将交联后的染色质打断成小片段，一般在200-600bp范围内。
在过去的几十年中，我们逐渐意识到调节染色质结构的过程的复杂性。从染色质可及性到远距离基因组组织，细胞使用了多种机制来控制基因表达。
DAP-seq(DNA亲和纯化测序)技术常见问题(input是什么)
1、DAP-SEQ是基于DNA亲和纯化，通过体外表达转录因子鉴定TFBS的技术，具有不受抗体和物种限制，且高通量的优势，自该技术问世以来，已被广泛应用于转录调控和表观组学的研究。
2、将一个标记的转录因子添加到DNA文库中，让它随机结合DNA，随后再分离出所有配对DNA-蛋白，这种方法叫做DNA亲和纯化测序（DAP-seq）。
3、染色质免疫沉淀后测序（ChIP-seq）是一种针对DNA结合蛋白，组蛋白修饰或核小体的全基因组分析技术。随着测序成本的降低，ChIP-seq已成为研究基因调控和表观遗传机制不可或缺的工具。
4、最早的chip-chip技术，是基于微阵列杂交原理的，旨在提供全基因组范围的DNA-蛋白质相互作用。在一个高密度的芯片上种有大量覆盖基因组或指定区域的探针。
5、但不可否认的是，现在很多非RNA类Single Cell测序，仍然在***用这样的技术，如Single Cell DNA-Seq，Single Cell ATAC-Seq等，都是***用此技术进行单细胞分选后再分别用不同试剂盒建库。
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